La serie è stata trasmessa per la prima volta il 15 febbraio 2007 sul canale televisivo giapponese TV Tōkyō, ed è tuttora in corso.[1] Gli episodi sono basati sulla seconda parte della serie manga Naruto del mangaka Masashi Kishimoto. Naruto: Shippūden è la continuazione del primo adattamento animato della serie, chiamato semplicemente Naruto, basato a sua volta sulla prima parte del manga. Naruto: Shippūden prosegue la trama della versione animata due anni e mezzo dopo la partenza del protagonista Naruto Uzumaki dal Villaggio della Foglia.[2] In Italia la serie è andata in onda dall'11 novembre 2008 al 6 aprile 2009, periodo nel quale sono stati trasmessi i primi 52 episodi. Mediaset ha ripreso la messa in onda a partire dal 15 settembre 2009 fino al 15 dicembre 2009 il martedì ed il giovedì alle ore 13:40 su Italia 1. Con l'episodio 53 sono state ripristinate anche le anticipazioni delle puntate successive, che erano state eliminate dall'episodio 52 della prima serie di Naruto.
Ad oggi sono stati utilizzati quindici brani musicali per le sigle dell'anime, cinque di apertura e dieci di chiusura. Dall'episodio 54 in poi gli episodi sono trasmessi in alta definizione e nel formato widescreen 16:9. Mediaset ha adottato questo formato a partire dall'episodio 53.
Naruto Shippuuden
01 - Ritorno a casa
02 - Alba in azione
03 - I risultati dell'allenamento
04 - Laforza portante della sabbia
05 - Nel ruolo di kazekage
06 - Missione compiuta
07 - Corri, Kankuro
08 - Interviene la squadra Kakashi
09 - Le lacrime della forza portante
10 - Tecnica di confinamento
11 - L'allieva del ninja medico
12 - La determinazione di Chiyo
13 - Incontro con il destino
14 - La maturità di Naruto
15 - La sfera nascosta
16 - Il mistero della forza portante
17 - La Fine di Gaara
18 - Irruzione!
19 - Scatta la Trappola!
20 - Hiruko contro le due Ninja
21 - Il vero volto di Sasori
22 - Le abilità segrete di Chiyo
23 - Padre e Madre
24 - Il Terzo Kazekage
25 - Tre minuti di immunità
26 - 10 marionette contro 100
27 - Il sogno irrealizzabile
28 - Il ritorno delle bestie
29 - Attivazione dell'occhio
30 - L'arte è un istante
31 - Ciò che resta
32 - Il ritorno del Kazekage
33 - Un nuovo bersaglio
34 - Nuova formazione
35 - Un'aggiunta indesiderata
36 - Falsi Sorrisi
